揚州大學學報編輯部是在原江蘇農學院、揚州師范學院、揚州工學院、江蘇商業專科學校等高校學報編輯部的基礎上，于1997年揚州大學合并辦學5周年之際成立。1997年創刊《揚州大學學報(人文社會科學版)》（雙月刊）、《揚州大學學報(高教研究版)》（季刊），2004年改為雙月刊；1998年創刊《揚州大學學報(自然科學版)》（季刊）；1999年將《江蘇農學院學報》更名為《江蘇農業研究》；2002年將《江蘇農業研究》更名為《揚州大學學報(農業與生命科學版)》（季刊）。
　　揚州大學學報編輯部現有專職編輯14人。專職編輯中具有正高專業技術職務的3人、副高5人，博士6人。編輯部設主任、副主任各1名，各版分設編輯室。

　　編輯部主任：薛曉陽；副主任：余海鵬
　　人文社會科學版主編：周新國；副主編：陳耀，劉從富（常務），錢澄；
　　自然科學版主編：郭榮；副主編：劉超，胡效亞，張遠（常務）；
　　高教研究版主編：姚冠新；副主編：劉延慶，葉柏森，薛曉陽，孫顯軍（常務）；
　　農業與生命科學版主編：焦新安；副主編：張洪程，秦愛建，劉明壽（常務）；       
　　揚州大學高度重視學報編輯部建設, 學報編輯部實現了編輯和工作流程的現代化。目前學報編輯部正進一步關注學術前沿，堅持品牌特色，倡導學術創新，打造名刊名欄，不斷向更高目標邁進。